目前，國內(nèi)現(xiàn)有的一些畜禽糞便發(fā)酵技術(shù)普遍存在著發(fā)酵，遠距離運輸，集中處理高成本的問題。同時因為發(fā)酵工藝落后，占地面積大，發(fā)酵過程中因發(fā)酵工藝落后造成地下水的污染和因發(fā)酵不全產(chǎn)生的氣味，使蚊蠅滋生對周圍環(huán)境產(chǎn)生嚴重影響。同時發(fā)酵生產(chǎn)受氣候影響嚴重，雨雪天無常工作，冬季因低溫導致設(shè)備無法處理糞便的現(xiàn)象。發(fā)酵時間普遍長達1-2個月，耗費工作人員數(shù)量多。

目前，化肥被大量施用以保持農(nóng)林業(yè)高產(chǎn)。但是，隨著化肥用量不斷增加，土壤開始板結(jié)，化肥淋入地下水也將造成水污染。近年來，我國提倡有機農(nóng)業(yè)，大量應(yīng)用有機肥，達到保持作物產(chǎn)量的同時，保護土地和環(huán)境。畜禽糞便是有機肥重要來源，2016年我國僅養(yǎng)殖肉牛產(chǎn)生的牛糞就達到15萬噸以上，為我國有機肥生產(chǎn)提供了充足的原料。另外，我國小麥歷年種植面積為我耕種地總面積的22％～30％，產(chǎn)生大量小麥秸稈，秸稈為養(yǎng)殖業(yè)提供飼料，也為有機肥生產(chǎn)提供了豐富原料。但是，豐富的原料只是生產(chǎn)的基礎(chǔ)，重要的是對這些原料的加工利用。其中關(guān)鍵的是有機肥原料的發(fā)酵腐熟技術(shù)不斷發(fā)展與創(chuàng)新。

生物菌肥的應(yīng)用范圍廣泛，可以用于農(nóng)田、果園、花卉、蔬菜等各類植物的生產(chǎn)中。它能夠改善土壤質(zhì)量，提高作物產(chǎn)量和品質(zhì)，降低化肥使用量，減少農(nóng)業(yè)對環(huán)境的負面影響。同時，生物菌肥還可以用于土壤修復和廢棄物處理等領(lǐng)域，具有很高的應(yīng)用前景和市場潛力。