專為運輸要求保持一定溫度的冷凍貨或低溫貨而設計的集裝箱。它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱。適用裝載肉類、水果等貨物。冷藏集裝箱造價較高，營運費用較高，使用中應注意冷凍裝置的技術狀態(tài)及箱內貨物所需的溫度。

冷藏集裝箱可用于多種交通運輸工具進行聯(lián)運
可以從產地到銷售點，實現(xiàn)“國到國”直達運輸，
一定條件下，可以當作活動式冷庫使用

冷藏集裝箱商品通常，冷藏貨物可以分成兩種：冷藏和冷凍
許多冷藏貨物（例如水果）被視為是“活性（live）”貨物，因為其在采摘過后仍然能夠進行呼吸并且由于自熱、早熟、干燥（萎蔫和枯萎）和其他條件而容易腐爛。

冷藏集裝箱的水果的低設定溫度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷凍貨物通常被認為是“惰性(inert)”貨物，一般在-18℃（0°F）或更低溫度下運載。既然冷藏和冷凍貨物都是易腐爛的，就注意確保這類貨物以佳狀態(tài)交付。對于冷藏貨物，除了有限的幾種例外情況（比如肉，巧克力，膠片，化學物品，奶制品，人工氣調儲藏運輸貨物）外，其通風設備通常要保持開啟狀態(tài)。

使用冷藏集裝箱的時候，要注意在冷藏箱裝滿貨之后檢查一些原有的質量，這樣才會確保質量是合格的。在裝箱的過程中，要按照裝貨堆碼的原則，這樣才可以更好的避免冷風短路降溫的情況，從而可以提高制冷設備的制冷效果。

在使用冷藏集裝箱的時候如果是長距離運輸，那么箱內的溫度差不能超過3度，這樣才可以箱內的溫度保持在一個恒溫的狀態(tài)。如果是運輸新鮮的水果或者是蔬菜，那么要及時打開新風口，可以進行通氣。