污水經(jīng)格柵進入調(diào)節(jié)池后經(jīng)提升泵進入生物反應(yīng)器，通過PLC控制器開啟曝氣機充氧，生物反應(yīng)器出水經(jīng)循環(huán)泵進入膜分離處理單元，濃水返回調(diào)節(jié)池，膜分離的水經(jīng)過快速混合法氯化消毒（次氯酸鈉、漂白粉、氯片）后，進入中水貯水池。反沖洗泵利用清洗池中處理水對膜處理設(shè)備進行反沖洗，反沖污水返回調(diào)節(jié)池。通過生物反應(yīng)器內(nèi)的水位控制提升泵的啟閉。膜單元的過濾操作與反沖洗操作可自動或手動控制。當(dāng)膜單元需要化學(xué)清洗操作時，關(guān)閉進水閥和污水循環(huán)閥，打開藥洗閥和藥劑循環(huán)閥，啟動藥液循環(huán)泵，進行化學(xué)清洗操作。

根據(jù)醫(yī)院性質(zhì)、規(guī)模和技術(shù)經(jīng)濟條件選擇消毒劑的種類。一般大中型醫(yī)院推薦使用液氯消毒工藝。在人口稠密的地方可采用次氯酸鈉消毒工藝。有條件的傳染病醫(yī)院可采用臭氧消毒工藝、小型醫(yī)院可采用氯片消毒工藝。四、放射性廢水、重金屬廢水及其他特殊廢水應(yīng)分別采取相應(yīng)的處理工藝，如放射性廢水采舊衰變貯存池處理，重金屬廢水可采用化學(xué)法或離子交換法處理。
根據(jù)醫(yī)院污水的排向和處理要求確定醫(yī)院污水處理的級別。如醫(yī)院污水是排入城市下水道，則根據(jù)《污水排入城市下水道的水質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)》和《醫(yī)院污水排放標(biāo)準(zhǔn)》要求，可采用處理消毒的工藝流程。如污水是直接排入地面水體，則應(yīng)按《污水綜合排放標(biāo)準(zhǔn)》要求進行處理，通常需要用二級處理消毒工藝。如有特殊要求時，甚至需要采用三級處理工藝，如在水源二級保護區(qū)以外的地面水三級水域或污水回用時。
醫(yī)院污水處理系統(tǒng)除了包括含菌污水的處理和消毒外，對其他各種特除排水根據(jù)需要還應(yīng)單處理，如含有重金屬的廢水，放射性廢水、含油廢水和洗印廢水等。重金屬廢水來自牙科治療和化驗室，含有汞，鉻等有害污染物，可用化學(xué)沉淀法或離子交換法處理。放射性廢水來自同位素治療和診斷。低濃度放射性廢水采用衰變池處理，或用化學(xué)共沉淀法、離子交換法處理。含油廢水來自廚房食堂，一般采用隔油池處理。洗印廢水來自照片洗印，含有銀、顯影劑、定影劑等有害物質(zhì)、含銀廢水可采用電解法回收銀，顯影劑可用化學(xué)氧化法處理。
新標(biāo)準(zhǔn)對醫(yī)院產(chǎn)生的污水、廢氣和污泥進行了全面控制，在強調(diào)對含病原體污水的消毒效果的同時，兼顧生態(tài)環(huán)境安全。在生物指標(biāo)上，新標(biāo)準(zhǔn)對排入下水道與排入水體的醫(yī)院污水提出不同要求。新標(biāo)準(zhǔn)嚴(yán)格區(qū)分醫(yī)院性質(zhì)，同時根據(jù)污水去向分為兩個等級，并在原有標(biāo)準(zhǔn)基礎(chǔ)上提出嚴(yán)格的控制各級指標(biāo)。新標(biāo)準(zhǔn)考慮了消毒效果和生態(tài)安全性問題，針對不同性質(zhì)醫(yī)院及污水去向?qū)ο緯r間和余氯量均作了明確規(guī)定，嚴(yán)格了余氯標(biāo)準(zhǔn)的上限。在理化指標(biāo)方面，對排入地表水體的醫(yī)院污水和傳染病醫(yī)院污水的COD、BOD5、SS、動植物油、石油類、陰離子表面活性劑等指標(biāo)都在原有標(biāo)準(zhǔn)基礎(chǔ)上進行了嚴(yán)格的控制，以增強污水處理系統(tǒng)的抗風(fēng)險性?？紤]氨氮也消耗消毒劑，對氨氮也提出了嚴(yán)格的要求。
醫(yī)院污水處理過程中排出的污泥按每張病床計，每天平均為0.7～1升，含水95%，含有污水中病原體總量的70～80%，進行消毒處理。消毒方法有加熱消毒、化學(xué)藥劑消毒、γ射線消毒等。加熱消毒的熱源通常為蒸汽、電能或生物能(高溫堆肥)，有的地區(qū)可以用太陽能。或者用焚燒法處理(見污泥焚燒)?；瘜W(xué)藥劑消毒可用漂白粉、石灰、氨水、液氯或苛性鈉等。用漂白粉或液氯時,有效氯用量約為污泥量的2.5%。用堿性藥劑時，污泥的pH值達到12后，保持半小時以上，效果好。