污水處理工藝就是對城市生活污水和工業(yè)廢水的各種經(jīng)濟、合理、科學、行之有效的工藝方法。污水處理被廣泛應用于建筑、農(nóng)業(yè),交通、能源、石化、環(huán)保、城市景觀、醫(yī)療、餐飲等各個領域。城市污水處理工藝應根據(jù)處理規(guī)模、水質(zhì)特性、受納水體的環(huán)境功能及當?shù)氐膶嶋H情況和要求，經(jīng)全面技術經(jīng)濟比較后優(yōu)選確定。

根據(jù)醫(yī)院性質(zhì)、規(guī)模和技術經(jīng)濟條件選擇消毒劑的種類。一般大中型醫(yī)院推薦使用液氯消毒工藝。在人口稠密的地方可采用次氯酸鈉消毒工藝。有條件的傳染病醫(yī)院可采用臭氧消毒工藝、小型醫(yī)院可采用氯片消毒工藝。四、放射性廢水、重金屬廢水及其他特殊廢水應分別采取相應的處理工藝，如放射性廢水采舊衰變貯存池處理，重金屬廢水可采用化學法或離子交換法處理。

根據(jù)醫(yī)院污水的排向和處理要求確定醫(yī)院污水處理的級別。如醫(yī)院污水是排入城市下水道，則根據(jù)《污水排入城市下水道的水質(zhì)標準》和《醫(yī)院污水排放標準》要求，可采用處理消毒的工藝流程。如污水是直接排入地面水體，則應按《污水綜合排放標準》要求進行處理，通常需要用二級處理消毒工藝。如有特殊要求時，甚至需要采用三級處理工藝，如在水源二級保護區(qū)以外的地面水三級水域或污水回用時。
醫(yī)院污水處理系統(tǒng)除了包括含菌污水的處理和消毒外，對其他各種特除排水根據(jù)需要還應單處理，如含有重金屬的廢水，放射性廢水、含油廢水和洗印廢水等。重金屬廢水來自牙科治療和化驗室，含有汞，鉻等有害污染物，可用化學沉淀法或離子交換法處理。放射性廢水來自同位素治療和診斷。低濃度放射性廢水采用衰變池處理，或用化學共沉淀法、離子交換法處理。含油廢水來自廚房食堂，一般采用隔油池處理。洗印廢水來自照片洗印，含有銀、顯影劑、定影劑等有害物質(zhì)、含銀廢水可采用電解法回收銀，顯影劑可用化學氧化法處理。
醫(yī)院污水處理流程選擇是醫(yī)院污水處理設計的關鍵，流程是否合理將直接影響處理效果、工程投資、運行費用以及管理安全等問題。根據(jù)醫(yī)院污水排出口的標高和所接入的城市下水道的標高之差，確定是采用自排式還是提升式的消毒工藝。高差大于600mm即可以采用虹吸定比自排式消毒工藝，高差較小時可采用超聲波自動定比投氯消毒工藝或提升式定比投氯消毒工藝。
醫(yī)院污水處理過程中排出的污泥按每張病床計，每天平均為0.7～1升，含水95%，含有污水中病原體總量的70～80%，進行消毒處理。消毒方法有加熱消毒、化學藥劑消毒、γ射線消毒等。加熱消毒的熱源通常為蒸汽、電能或生物能(高溫堆肥)，有的地區(qū)可以用太陽能?；蛘哂梅贌ㄌ幚?見污泥焚燒)?；瘜W藥劑消毒可用漂白粉、石灰、氨水、液氯或苛性鈉等。用漂白粉或液氯時,有效氯用量約為污泥量的2.5%。用堿性藥劑時，污泥的pH值達到12后，保持半小時以上，效果好。