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、在醫(yī)學上主要的應用途徑是作為治療關節(jié)疾病的藥品，與氨基葡萄糖配合使用，具有止痛，促進軟骨再生的功效，可以從根本改善關節(jié)問題。
提供墊襯作用，緩和行動時的沖擊和摩擦，能將水分吸入蛋白多糖分子內，使軟骨變厚，并增加關節(jié)內的滑液量。軟骨素的重要功能之一就是作為輸送管道，把重要的氧供和營養(yǎng)素輸送至關節(jié)，幫助清除關節(jié)內的廢物，同時把二氧化碳和廢物加以排除。由于關節(jié)軟骨并無血液供應，因此所有的充氧、滋養(yǎng)及潤滑作用皆來自滑液。
硫酸軟骨素對角膜膠原纖維具有保護作用，能促進基質中纖維的增長，增強通透性，改善血液循環(huán)，加速新陳代謝，促進滲透液的吸收及炎癥的消除；其聚陰離子具有強的保水性，能改善*組織的水分代謝，對角膜有較強的親和力，能在角膜表面形成一層透氣保水膜，改善眼部干燥癥狀。通過促進基質的生成，為細胞的遷移提供構架，有利于角膜上皮細胞的遷移，從而促進角膜創(chuàng)傷的愈合，滲出液的吸收及炎癥的消除。
硫酸軟骨素（CS）是共價連接在蛋白質上形成蛋白聚糖的一類糖胺聚糖。硫酸軟骨素廣泛分布于動物組織的細胞外基質和細胞表面，糖鏈由交替的葡萄糖醛酸和N-乙酰半乳糖胺（又稱N-乙酰氨基半乳糖）二糖單位組成，通過一個似糖鏈接區(qū)連接到核心蛋白的絲氨酸殘基上。
硫酸軟骨素存在于從線蟲到人除植物外的所有生物中，發(fā)揮著許多重要的生理功能。雖然多糖的主鏈結構并不復雜，但就硫酸化程度、硫酸基和兩種差異向異構糖醛酸再鏈內的分布來說，呈現(xiàn)高度的不均一性。硫酸軟骨素的精細結構決定著功能的特異性和與多種蛋白質分子的相互作用。
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