藍莓苗的根系沒有根毛。正因如此，藍莓根系的吸收能力比具有根毛的根系小得多。其吸收面積只有同樣大小具有根毛的小麥根系的1/10。藍莓的根系細，呈纖維狀，細根在分枝前直徑為50～75um。
值得注意的是，幾乎所有藍莓的細根都有內生菌根的寄生，從而克服藍莓根系由于沒 有根毛造成的對水分及養(yǎng)分的吸收困難。近年來，眾多的研究已，菌根的寄生對藍莓生長是有益的。
矮叢藍莓根系的主要部分是根狀莖。據(jù)估計，矮叢藍莓大約85%的莖組織為根狀莖。不定芽在根狀莖上萌發(fā)，并形成枝條。根狀莖一般為單軸形式，直徑3～6。根狀莖分枝頻繁，在地表下6～25深的土層內形成緊密(穿插)的網狀結構。新發(fā)生的根狀莖一般為粉紅色，而老根狀莖為暗棕色并且木栓化。矮叢藍莓的根系分布在上層中的有機質層。

藍莓苗選址
藍莓對土壤、氣候要求非常高，除了大家都關注的土壤PH值外，一些微量元素對藍莓栽植也是致命因素，降水、氣溫等氣候水文條件同樣至關重要。

藍莓苗溫度要求：小拱棚內溫度適宜范圍為15-30℃，白天比較適范圍22-25℃，夜間17-20℃。低于13℃或32℃不利于生根。溫度過高時，要及時降溫，可采取遮蔭或噴水降溫方式。在根群形成前，植株新葉未萌生。盡量不采取揭膜放風降溫，以免植株受到傷害。移苗前5-7 d揭去薄膜，適當煉苗，溫度10℃即可，提高移栽成活率。

藍莓苗濕度要求：藍莓生根馴化階段空氣相對濕度適宜范圍為60%～90%。當濕度降低時，采取微噴方式增加濕度。不同時期對濕度的要求不同，初期(定植后一新根初始形成)保持高濕狀態(tài)，不低于75%，確保植株不失水，利于生根。

藍莓苗繁殖定植溝和定植穴的深度達到45～50厘米，而栽苗的深度顯然不會有這么深，挖這么深的溝、穴只是為了改良深層的土壤而已，即定植時對溝、穴中的土壤進行下層填充。若土壤偏黏，在定植溝或定植穴中要摻人泥炭或腐熟的碎樹皮、干草、鋸屑等，上面蓋10厘米左右的土，以避免未腐熟的植物殘體和苗木根系直接接觸。也可在溝、穴土壤的下層預施少量農家肥或無機復合肥作底肥，并將肥料與土充分混合，上面同樣蓋一層土。下層施肥有利于根系向縱深發(fā)展。

藍莓苗的根系適宜疏松、有機質含量高的酸性基質，一般pH值4.0～5.2為宜。不同的品種、苗齡、生育期對基質要求差異較大。小苗期對基質要求嚴格，隨著苗齡的增長，對基質的要求可適當放寬。